工程款在结算时需要缴纳的税种包括以下几种：
个人所得税：
工程结算款的1%。
印花税：
工程结算款的0.3‰。
营业税：
工程结算款的3%。
城建税：
根据营业税的税额，税率分别为1%、5%或7%，具体比例取决于纳税人所在地。
教育费附加：
按营业税的3%计算缴纳。
地方教育费附加：
根据地方政策规定缴纳，比例通常为教育费附加的一定比例。
水利建设基金：
根据收入的一定比例计提和交纳，具体比例根据地方规定而定。
此外，如果工程款是通过个人收取，可能还需要缴纳增值税、附加税和个人所得税。增值税税率为1%，附加税为增值税的6%，个人所得税一般按照20%—40%的税率征收，但在某些园区可以申请享受自然人代开政策，个人所得税可享受到0.5%—1%的优惠。
对于个体工商户和有限公司收取工程款，需要缴纳的税种包括增值税、个人经营所得税、附加税等。增值税税率为1%，附加税为增值税的6%，个人经营所得税按照查账的方式征收，即5%—35%的五级累进制计算。如果年应纳税额在200万以下，个税可享受减半征收政策。在园区中的个体工商户企业，个人经营所得税核定征收政策，个税核定0.5%—1%之间。
建议在实际操作中，咨询当地税务部门或专业税务顾问，以确保准确了解和遵守相关税收政策。
