基因工程的应用非常广泛，主要包括以下几个方面：

农业领域

转基因作物：通过基因工程技术将特定基因导入植物体内，使其获得抗虫、抗病、抗逆（如抗盐碱、抗旱）等特性，从而提高作物的产量和质量。例如，国产转基因抗虫棉能够抵抗棉铃虫的侵害。

动物基因工程：通过基因工程提高动物的生长速度、改善畜产品品质，以及生产药物蛋白。例如，通过转基因技术使动物的乳汁中含有药用蛋白，这样从乳汁中获取药物更加方便。

医药领域

生物制药：利用基因工程开发微生物反应器、动物反应器和植物反应器，生产具有生物活性的药物和疫苗。例如，重组人胰岛素、重组人干扰素α1b、重组人血清白蛋白以及基因工程乙肝疫苗等。

基因治疗：通过将正常基因导入病人体内，使其表达产物发挥功能，从而达到治疗疾病的目的。包括体内基因治疗和体外基因治疗。例如，CAR-T（嵌合抗原受体T细胞免疫治疗）技术在治疗癌症等疑难杂症中显示出巨大潜力。

环境保护

生物修复：利用基因工程培育的指示生物或“超级细菌”来检测、吸收和转化环境中的污染物。例如，基因工程细菌能够分解石油中的多种烃类化合物，以及汞、镉等重金属，还能分解DDT等毒害物质。

环境监测：基因工程制成的DNA探针能够灵敏地检测环境中的病毒、细菌等污染。

工业领域

生产药物蛋白：通过动物反应器生产具有特定功能的蛋白质，如抗体、生长激素等。

生物材料：利用基因工程改造微生物或植物细胞，生产高性能的生物材料。

其他领域

食品工业：通过基因工程改善食品的品质和安全性，例如生产不会引起过敏的转基因大豆。

特殊用途动植物：培育具有特殊用途的动植物，如超级动物、特殊用途的猪和小鼠。

随着科技的不断进步，基因工程的应用领域还将继续拓展，为人类带来更多的福祉。