福建工程学院的王牌专业包括：

土木工程：

这是福建工程学院历史最久、实力最强、人数最多、师资最强、就业最好的专业，在福建省内及业内具有很高的声誉。

工程造价：

该专业在福建省内及业内也有很高的认可度。

电气工程及其自动化：

这个专业培养具备电气工程领域相关的基础理论、专业技术和实践能力，就业前景广阔。

交通运输工程：

在福建省内及业内具有很高的声誉。

材料科学与工程：

该专业在福建省内及业内也有很高的认可度。

机械工程：

这个专业在福建省内及业内具有很高的声誉。

管理科学与工程：

该专业在福建省内及业内也有很高的认可度。

交通信息工程及控制：

在福建省内及业内具有很高的声誉。

材料加工工程：

该专业在福建省内及业内也有很高的认可度。

岩土工程：

这个专业在福建省内及业内具有很高的声誉。

结构工程：

该专业在福建省内及业内也有很高的认可度。

机械电子工程：

这个专业在福建省内及业内具有很高的声誉。

车辆工程：

该专业在福建省内及业内也有很高的认可度。

电力系统及其自动化：

这个专业在福建省内及业内具有很高的声誉。

环境工程：

该专业在福建省内及业内也有很高的认可度。

软件工程：

该专业入选国家级一流本科专业建设点，具有很高的学术水平。

建筑环境与能源应用工程：

该专业入选国家级一流本科专业建设点，具有很高的学术水平。

建筑学：

该专业入选国家级一流本科专业建设点，具有很高的学术水平。

法学：

该专业入选省级一流本科专业建设点，具有很高的学术水平。

英语：

该专业入选省级一流本科专业建设点，具有很高的学术水平。

信息与计算科学：

该专业入选省级一流本科专业建设点，具有很高的学术水平。

道路桥梁与渡河工程：

该专业入选省级一流本科专业建设点，具有很高的学术水平。

公共事业管理：

该专业入选省级一流本科专业建设点，具有很高的学术水平。

通信工程：

该专业入选国家级一流本科专业建设点，具有很高的学术水平。

计算机科学与技术：

该专业入选国家级一流本科专业建设点，具有很高的学术水平。

给排水科学与工程：

该专业入选国家级一流本科专业建设点，具有很高的学术水平。

城乡规划：

该专业入选国家级一流本科专业建设点，具有很高的学术水平。

材料成型及控制工程：

该专业入选省级一流本科专业建设点，具有很高的学术水平。

这些专业在学术水平、师资力量、就业前景等方面都有很高的评价，建议学生在选择专业时优先考虑这些王牌专业。