物流工程专业的学生在考取证书时，可以考虑以下几种：

物流工程师职业资格证书

涵盖物流系统规划、设计、优化等方面的知识与技能考核，有助于从事物流系统规划与设计相关工作。

机械工程师证书（物流设备方向）

考核机械原理、机械设计、设备故障诊断与维修等内容，与物流工程中自动化设备、装卸搬运设备等相关知识紧密相连。

仓储管理员证书

适合从事仓储管理的岗位，涉及库存管理、货物保管、出入库流程等工作。

采购管理师证书

用于采购管理相关岗位，涉及供应商选择、采购谈判、采购执行等工作。

信息化物流管理师证书

适合从事物流信息化相关工作，涉及物流信息系统、大数据分析、物联网技术等内容。

国际物流师证书

适合从事国际物流相关岗位，涉及国际货物运输、贸易流程、国际货运代理等工作。

物流仓储师证书

涵盖物流仓储管理的知识与技能，适合从事物流仓储相关岗位。

供应链管理师证书

涉及供应链规划、物流协同、供应商管理等工作，适合从事供应链相关领域的工作。

市场营销师证书

适合从事物流市场营销相关岗位，涉及市场分析、营销策划、客户关系管理等工作。

项目管理师（PMP, IPMP, CPMP认证）

适用于项目管理领域，对于希望进入项目管理行业的学生来说非常有价值。

电子商务师证书

对于希望进入电子商务领域的学生来说，这个证书可以帮助他们获得相关技能。

报关员从业资格证

通过全国报关员资格考试取得报关从业资格，在海关注册登记后可以代表单位办理进出口货物报关业务。

物流设备操作证书

掌握物流设备如叉车、输送带等的操作技能。

现代物流信息技术应用证书

学习物流信息化、大数据分析、物联网等方面的知识。

质量管理师资格证书

了解质量管理理论、方法、工具和实施技巧。

中国物流职业经理证书

分为初级、中级和高级，根据课程考试合格获得相应级别的资格证书。

选择考取哪个证书取决于个人的职业发展目标以及所在地区的具体需求。建议根据自身兴趣和职业规划，选择最符合自己发展方向的证书进行考取。