环保工程公司在办理资质时，需要遵循以下步骤：

了解资质标准

根据《建筑业企业资质标准》，环保工程专业承包资质分为一级、二级、三级。每个等级的资质都有相应的企业资产、主要人员和工程业绩的要求。

准备申请材料

申请环保工程专业承包资质的企业应当向住房城乡建设部门提交以下材料：

申请表

营业执照副本复印件

法定代表人身份证复印件

近三年审计报告

主要人员名单及其职称证书、注册建造师执业证书、岗位证书等复印件

近五年完成的环保工程合同及竣工验收文件复印件

其他相关材料。

提交申请并接受审核

申请材料准备好后，可以通过住房城乡建设部门的网上服务平台或现场窗口提交申请。

住房城乡建设部门收到申请后，应当在20个工作日内完成审核，并出具审核意见。审核意见分为同意、补正或不予受理三种。

进行公示和等待公告

资质材料整理完成后，向所在建筑业管理部门提交资质申请材料。

建筑主管部门对资质申请材料进行审核，对属于核准范围的资质进行公示，公示之后无异议的予以核准，等待公告。

领取资质

公告公示后，前往资质审核主管部门领取资质。

建议

提前规划：企业应提前了解资质办理的相关政策和标准，明确自身所需申请的资质等级和业务范围。

精心准备：确保申请材料的真实性和完整性，避免因材料问题导致办理失败。

积极配合：在审核过程中，企业需积极配合政府部门的审核工作，提供必要的支持和协助。

持续更新：企业应定期更新资质相关的证书和资料，确保资质的有效性。

通过以上步骤，环保工程公司可以顺利完成资质的办理，从而获得从事环保工程业务的资格。