如果企业因环保问题被查，可以采取以下措施：
积极收集证据
企业应当第一时间收集所有环保手续齐全的证据资料，并与相关部门进行协商，以证明企业已经尽力遵守环保法规。
立即停止生产
企业应当立即停止生产，配合环保部门的检查，避免进一步的法律责任。
缴纳罚款并进行整改
如果企业因环保不达标被罚款或被责令停产、关停，应当按要求缴纳罚款，并根据环保部门的要求进行整改，使各项指标达标后重新开始生产。
申请行政复议或提起行政诉讼
如果企业对环保部门的处罚意见不服，可以向有关机构申请行政复议或者向人民法院提起行政诉讼，维护自己的合法权益。
与员工沟通并处理劳动合同
对于因环保停产整顿的员工，企业应当按照劳动合同法的规定进行经济补偿，支付经济补偿金，并处理社会保险缴纳等问题。
进行环评并上环保设备
企业应当委托第三方进行环境影响评价，根据环评报告的指导，安装相应的环保设备，确保生产过程符合环保要求。
搬迁或消除污染
如果企业无法立即整改达标，可以考虑搬迁到符合环保要求的地方，或者采取其他措施消除污染。
通过以上措施，企业可以尽量减少因环保问题带来的负面影响，并尽快恢复正常生产。同时，企业也应当加强内部管理，确保今后严格遵守环保法规，避免类似问题再次发生。
