南京的环保认证机构包括以下几家：
南京市环保局：
作为南京市政府的组成部门，负责推动环保工作，并提供相关的环保认证服务。
江苏省环保科学研究院：
作为江苏省内知名的环保研究机构，提供环保认证相关的技术支持和咨询服务。
南京市环境监测中心：
具备计量认证（CMA）资质和中国实验室国家认可（CNAS）资质，是国家试验室认可的协作定值实验室，提供环境监测和认证服务。
南京华宇环境管理体系认证中心：
主要提供环境工程设计及技术服务，经营范围包括环境管理体系认证等。
南京恒泰：
江苏省技术监督局授权的第三方省级权威检测机构，专业从事室内环境检测、家具检测等，拥有国家认证检测资质。
智方环保：
集研发、设计、生产为一体的环保产业集团，旗下有南京智方环保工程有限公司，专业从事环境影响评价业务。
中环检测集团水质检测中心：
提供水质污染检测、水源地评估、饮用水安全检测、工业废水检测、重金属与微生物检测等服务。
南京聚格环境科技有限公司：
其紫外（UV）吸收水质自动在线监测仪AG-C08型获得了ccep中国环境保护产品认证证书。
南京无忧水质检测公司 、 南京中环检测中心、 南京C环境检测机构、 南京中环测第三方检测站、 南京久陆水质检测服务部：
这些是南京可能存在的五家水质检测第三方检测机构。
建议您根据具体需求和认证类型，选择合适的环保认证机构进行咨询和办理。
