环保协查的主要内容包括以下几个方面：

企业生产情况

企业所属行业及主要产品

产品及产能，各线是否存在运营

企业是否违法建设，是否环评一致

有无新增废气、废水、固废等污染物

企业环保落实情况

项目是否依法履行环评手续，查看环评文件及环评批复

环评文件（环评公参）是否涉及造假

项目的性质、生产规模、地点、采用的生产工艺或采用的污染治理措施等是否与环评及批复文件一致

环评批复五年后项目才开工建设的，是否重新报批环评

检查项目投运后，是否进行了环保竣工验收，环保竣工验收手续是否完备

现场环保设施及措施

生产配件的同时有出来粉末的辅料、相关的燃煤锅炉等设备要查封

发现有噪音、气味浓的产品也要整顿

没有营业执照、不规范的厂家需要重新整顿

顺带查存在消防安全隐患的

顺带查伪劣及假冒仿牌的

偷排废水

排放油漆味等刺鼻气体

低频噪音或噪音过大

粉尘污染

未公示环评

无环保审批手续

电机组存在运行安全隐患

违法建设

私设暗管排污

煤渣到处飘散

纸渣挖坑填埋存在问题

无废水回收系统

未办理取水许可

没有亮照经营

无防渗漏措施的水塘存贮其他废弃物

治污设施简陋老旧问题

烟尘排放浓度超标

厂区堆积垃圾未及时处理

未办理环境影响评价文件报批手续

其他相关检查

重点盯住中央高度关注、群众反映强烈、社会影响恶劣的突出环境问题及其处理情况

重点检查环境质量呈现恶化趋势的区域流域及整治情况

重点督察地方党委和政府及其有关部门环保不作为、乱作为的情况

重点了解地方落实环境保护党政同责和一岗双责、严格责任追究等情况

检查企业是否依法取得相关环保许可、备案文件，如环境影响评价文件、环保验收文件、排污许可证、危险废物经营许可证、辐射许可证等

检查企业是否按照生态环境保护法律、规定以及行业要求建立完善的生态环境保护制度

检查企业是否按照法律法规、许可备案文件和政策的要求，落实生态环境保护措施，建设相应的污染防治设施并确保正常运行

检查企业是否存在违法排污和生态破坏行为，是否存在环境违法行为

检查企业是否存在其他生态环境违法行为以及环境管理的问题

综上所述，环保协查的内容涵盖了企业生产情况、环保落实情况、现场环保设施及措施以及其他相关检查，旨在确保企业严格遵守环保法律法规，保护环境，防止污染。