需要环保指标证书的企业主要包括以下几类：

生产加工制造类企业

从事生产加工制造类的企业在注册时必须要有环评手续，但不包括个体营业者。

排污企业

生产过程进行排污或排污超标的企业是环保部门重点监测的对象，需要定期或不定期进行实地检测，如化工、造纸、冶炼等排污严重的企业。

可能产生污染物的企业

在生产经营过程中可能产生污染物的企业，若直接向环境排放应税污染物（如大气污染物、水污染物、固体废物和噪声等），则需依法办理环保许可证。

环境治理服务企业

专业环境治理服务企业需要具备环境治理服务企业资质证书，该证书要求企业具备足够的注册资本、专业的技术人员和先进的治理技术，以及良好的业绩和信誉。

环保咨询服务企业

环保咨询服务企业需要具备环保咨询服务企业资质证书，这些证书要求企业具备丰富的环保知识和实践经验，以及独立法人资格和完善的咨询服务体系。

环保工程专业承包企业

这类企业需要具备环保工程专业承包资质，证明其在环保工程设计、施工等方面具有专业的技术和丰富的经验。

环境污染治理设施运营企业

负责运营和管理环境污染治理设施的企业需要具备环境污染治理设施运营资质，证明其在设施运营和管理方面具有专业的技能和经验。

环保产品生产企业

生产环保产品的企业需要获得环保产品认证，证明其产品在环保性能和使用寿命等方面达到了一定的标准。

其他环保相关企业

还有一些其他与环保相关的证书，如环保技术研发能力认证、环保服务体系认证等，这些证书都是企业在环保领域专业实力和信誉的体现。

综上所述，需要环保指标证书的企业包括各类生产加工制造类企业、排污企业、可能产生污染物的企业、环境治理服务企业、环保咨询服务企业、环保工程专业承包企业、环境污染治理设施运营企业、环保产品生产企业以及其他环保相关企业。