环保局在调查环境违法行为时，通常会遵循以下步骤：

立案

环境行政主体在接到控告检举材料或自己发现违法行为后，认为需要给予行政处罚的，应予以立案。立案应填写《立案报告表》，并指派承办人员负责案件的调查工作。

调查取证

调查取证是案件承办人员核实案件事实和收集证据的过程。执法人员不得少于两人，并向当事人或有关人员出示证件。调查过程中可以采取实地检查、勘察、监测等手段，并制作相关笔录和报告。在证据可能灭失或难以取得的情况下，可以先行登记保存，并在规定时间内作出处理决定。

审查调查结果

调查终结后，承办人员应提出事实结论和处理结论的书面意见，由环境行政主体负责人审查批准。对于情节复杂或重大违法行为，应集体讨论决定，并在决定作出前依法向当事人履行告知义务，听取其陈述和申辩。

制作行政处罚决定书

根据审议、申辩与听证结果，法制股责成监察大队制作《行政处罚决定书》，由局长签发。该决定书应在立案之日起3个月内作出。

其他相关程序

对于不需作出行政处罚的案件，职能部门需填写《撤销立案审批表》交法制股，经分管局长签署意见后归档。对于重大行政处罚，当事人有权要求听证，听证会由法制股非本案调查人员主持，调查人员参加。

暗查和其他灵活调查方式

在特定情形下，生态环境主管部门可以采用暗查或其他灵活的调查方式，以避免被调查对象提前知晓而进行刻意掩盖或伪装，从而获取更为真实可靠的调查结果。

技术支持和专业人员参与

在调查或检查过程中，可以组织监测等技术人员提供技术支持，对复杂的环境数据和现象进行精准解读与分析，提升执法工作的质量与效率。

通过以上步骤，环保局能够全面、客观、公正地调查环境违法行为，确保调查结果的准确性和合法性，并依法作出相应的行政处罚决定。