在苹果6s上设置指纹密码的步骤如下：
1. 打开手机主界面，选择“设置”。
2. 在设置菜单中，找到并选择“Touch ID与密码”。
3. 如果之前已经设置过数字密码，会提示你输入密码，这个密码是手机的开机密码，输入后继续下一步。
4. 在指纹设置页面，点击“添加指纹”。
5. 将手指放在主屏幕按钮上，按照屏幕提示进行指纹录入，需要重复按压直到系统提示指纹录入完成。
6. 录入完成后，指纹就会被添加到系统中，你可以使用这个指纹来解锁手机或进行其他需要指纹验证的操作。建议：在设置指纹时，建议选择自己习惯使用的手指，并且确保在录入过程中手指放置稳定，以便系统能够准确识别指纹。
