魅族PRO5系统主要有两个版本：**Flyme 4.5** ：这是魅族PRO5在2015年11月15日前预装的系统。
该系统基于原生Android进行本地化优化，以清新的风格著称，系统稳定流畅，配合mTouch按键体验优秀，得到了消费者的好评。**Flyme 5.0** ：Flyme 5.0系统在2015年11月15日左右开始提供，对系统底层进行了更深入的优化，以挖掘手机性能，系统完善度相比之前有很大提升，系统更加稳定流畅。因此，魅族PRO5系统预装的是Flyme 4.5系统，而Flyme 5.0系统则需要到11月15日左右才能获取。
