养殖基地的管理和监管涉及多个部门，具体负责部门如下：
农业部
从国家层面负责养殖技术的指导和政策制定。
畜牧兽医行政主管部门
国务院畜牧兽医行政主管部门负责全国畜牧业的监督管理工作。
县级以上地方人民政府畜牧兽医行政主管部门负责本行政区域内的畜牧业监督管理工作。
农业农村部门
农业农村（渔业）部门负责深远海养殖生产的监督管理。
农业农村部会同有关部门印发通知，组织排查整治非法捕杀野生蚯蚓行为。
自然资源部门
负责养殖海域使用的监管。
生态环境部门
负责养殖生态环境的监管。
县级以上人民政府环境保护主管部门负责畜禽养殖污染防治的统一监督管理。
海事部门
负责重力式网箱、桁架类网箱及养殖平台施工作业通航安全的监管。
海警和渔政、海洋和生态环境等领域执法机构
在职责范围内抓好相关执法监管。
乡镇政府
协助有关部门做好本行政区域的畜禽养殖污染防治工作。
土地管理部门和畜牧管理部门
个人或企业建设养驴基地时需要办理审批手续。
环境保护部门
对畜禽养殖污染防治进行统一监督管理。
质监局、工商局、安监局
负责养殖基地的监管责任。
建议养殖基地的建设和管理应综合考虑上述各部门的职责，确保合法合规并得到有效监管。
