室内养殖需要办理的手续包括：
土地手续
办理生产设施用地的备案手续，签订用地协议，并在国土局和农业局备案。养殖场的选址还需通过规划局的审批。
环境影响评价
养殖项目属于易造成环境污染的项目，从选址到最终养殖场生产运行整个流程都需要通过环评进行认定和分析预测，需要配套建设污染防治设施。环评手续需到环保局办理。
排污许可证
在依法实施污染物排放总量控制的区域内，畜禽养殖场必须按规定取得《排污许可证》，并按照《排污许可证》的规定排放污染物。随着养殖环保整治力度越来越大，《排污许可证》未来可能成为每个养殖场的必备手续。
动物防疫条件合格证
建设养殖场时一定要办理动物防疫条件合格证，向县级以上地方人民政府兽医主管部门申请。
养殖证 （针对特定养殖类型）：
国家要求海域水产养殖和内陆水域养殖户需要办理的证件。对于驯养繁殖可人工养殖的野生动物时，一定要办理野生动物驯养繁殖许可证。在线预审通过之后，按照预约时间去工商局递交申请材料。
工商登记
领取执照，收到准予设立登记通知书后，去工商局领取营业执照。
养殖场备案登记手续
办理养殖场备案登记手续。
建议您在办理室内养殖手续时，详细咨询当地相关部门，确保手续齐全并符合法规要求，以顺利推进养殖业务。
