养殖证件的申办单位主要取决于养殖类型和地点，具体如下：

养殖用地证明 ：可以到国土资源局办理。

环评手续：

到环保局办理。

规划意见：

养殖场设计好建设图纸后，到规划局审核。

立案备案手续：

先让村委会证明，然后到畜牧局，畜牧局审核过后，直接到工商局办理。

新建养殖场申请流程和证件办理

先跟村里或土地经营者签订土地流转合同，确定养殖用地性质及其范围。

再向当地政府提出养殖项目申请，当地政府工作人员对养殖用地进行实地勘察，对符合条件的，出具同意养殖项目的批复意见和适养区证明，并发函告知当地畜牧兽医局。

经过县农委立项之后，向当地国土部门申请建设指标，国土部门核准后出具证明，可能需要缴纳一笔复耕保证金。

向当地兽医畜牧局提交畜禽养殖发展规划书，经审核后，兽医畜牧局出具符合养殖发展规划证明。

向环保和检疫部门申请办理环保手续和动物防疫条件合格证。

向国土部门申请养殖用地和备案，取得备案后带上办齐全的证件到工商部门申请办理登记注册手续，领取营业执照。

海域和内陆水域养殖证办理

办理地点：

向县级以上地方人民政府渔业行政主管部门即林业局动管站办理。

办理条件

申请人须具备相应的野生动物养殖经验，或聘请养殖技术人员。

有养殖野生动物的固定场所。

申请流程

向县级以上地方人民政府渔业行政主管部门提出申请，填写申请表。

提交与养殖规模相适应的资信证明材料、养殖技术条件说明等。

县级以上地方人民政府渔业行政主管部门应认真审查申请材料，并会同有关单位人员进行现场勘验，确认标界，核实有关情况。

经审核，对符合规定的，渔业行政主管部门应报请有审批权的人民政府批准，颁发养殖证。

总结

陆地养殖：

主要涉及国土资源局、环保局、规划局和工商局。

海域和内陆水域养殖：主要涉及县级以上地方人民政府渔业行政主管部门（如林业局动管站）。

建议根据具体的养殖类型和地点，选择相应的部门进行申请，以确保顺利办理养殖证件。