在龙虾池养殖中，可以使用以下几种菌种：

EM菌

EM菌（有效微生物群）是一种综合性的微生物制剂，包括乳酸菌、酵母菌、放线菌等多种有益微生物。它们在水体中发挥着分解有机物、提供营养、抑制病菌、调节pH值等多重作用。通过合理使用EM菌，可以促进小龙虾塘的生态平衡，提高水质，减少病害，从而促进小龙虾的生长。

光合菌

光合菌可以抑制虾塘底层超标的氨氮含量和过多的有机质，同时通过光合作用分解转化塘口有害物质增加氧气，为有益藻类的繁殖提供了良好的生存环境。这有助于为虾塘浮游生物的大量繁殖提供条件，浮游生物则为小龙虾提供了天然饵料。

酵母菌

酵母菌在虾塘里通过微生物分解发酵后，能够将有害物质转化为肥水必须的氨基酸和游离磷元素和氮元素。这可以间接改底，培藻培菌。

芽孢杆菌

芽孢杆菌具有强大的净水能力，能够分解水体中的有机物，减少水体富营养化，同时释放有益物质促进藻类生长，稳定水质。芽孢杆菌还可以抑制有害藻类的滋生和生长，并对老水、黑水等异常水有较好的调节作用。

硝化细菌

硝化细菌可以有效地降解龙虾养殖池塘的亚硝酸盐，加速水体中有机废物的分解和氧化，减少有机废物的沉淀，并有效阻断有害菌的营养来源，从而抑制有害菌的增长。

建议

初期使用：养殖前期建议选择EM菌和酵母菌，以辅助藻类生长繁殖。

中期使用：养殖中期可以选择芽孢杆菌、光合菌和乳酸菌，以净化水质。

后期使用：养殖后期建议选择硝化细菌、乳酸菌、光合菌和芽孢菌，以平衡水质。

通过合理使用这些菌种，可以有效提升龙虾池的水质，促进小龙虾的健康生长，减少病害的发生。建议在肥水后的1-2周内开始使用EM菌，并在不同养殖时期适时补充其他菌种，以达到最佳效果。