在水稻田中养殖，可以使用以下几种菌种：

大球盖菇：

大球盖菇是一种草腐菌，能够利用水稻收割后的空闲田进行栽培。其栽培原料主要为各类秸秆，整个生长期不施用任何肥料和农药，收获后的菌渣可作为天然有机肥，为水稻提供养分。

复合益菌：

这是一种通过高科技生物技术研制的复合农用微生物菌剂，含有丰富且高价值的活性菌，具有固氮、解磷、释钾，促进土壤有机质分解、抑菌抗虫、改善土壤中微生物群、改良土壤结构的功能。与各种有机肥、农家肥等配施，可以显著提高肥料的利用率，满足作物各生育期养分的需求，改善土壤环境，降低肥料成本，提高产量和品质，降解农药残留。

羊肚菌：

羊肚菌是一种在水稻田中种植的高效菌种，具有较高的经济价值。通过“稻-菌轮作”模式，可以在冬闲稻田种植羊肚菌，不仅能够提高土地利用率，还能获得可观的经济收益。

种植益生菌：

这类产品含有益生菌，能够提供营养元素，促进作物健康生长，增强作物的抗病、抗虫能力，改善土壤环境。

生物农药：

在水稻种植中，还可以使用一些生物农药，如阿维菌素、井冈霉素、春雷霉素、苏云金杆菌（Bt）等，这些生物农药对水稻无害，能有效防治病虫害。

建议

选择合适的菌种：根据具体需求和条件，选择适合的菌种进行养殖。例如，如果追求有机种植和土壤改良，大球盖菇和复合益菌是不错的选择；如果追求高效经济收益，羊肚菌可能更适合。

科学栽培：在使用这些菌种时，应遵循科学的栽培方法，包括菌种的选择、土壤处理、施肥和水分管理等，以确保菌种能够充分发挥作用，提高养殖效果。

综合防治：生物农药和生物菌剂可以配合使用，形成综合防治体系，既能够有效防治病虫害，又能减少对环境的污染。

通过合理选择和使用这些菌种，可以在水稻田中实现高效、环保的养殖模式，提高产量和品质，同时降低对环境的负担。