在养殖水质检查中，通常会检查以下病菌和指标：
氨氮：
用于评估水体中蛋白质分解产生的氨含量，过高会对养殖生物造成危害。
pH值：
酸碱平衡对养殖生物的生长至关重要，异常的pH值会影响生物的健康。
亚硝酸盐：
亚硝酸盐是氨氮氧化的中间产物，过高会对养殖生物造成毒害。
水温：
水温直接影响养殖生物的新陈代谢和生长。
溶氧量：
水体中溶解氧的多少决定了养殖生物能否正常呼吸。
水体透明度：
透明度可以反映水质的好坏，通常透明度越高，水质越好。
藻类藻种分布数量：
藻类过度繁殖会导致水质恶化，影响养殖生物的健康。
微生物和细菌：
包括有益菌和有害菌，需要定期监测以防止疫病爆发。
总大肠菌群：
作为粪便污染的指标，总大肠菌群的存在表明水体可能受到人畜粪便的污染。
粪大肠菌群：
在较高温度下仍能生长的大肠菌群，是水体受人畜粪便污染的直接指标。
重金属：
如铜、汞、镉、铅、铬、锌等，这些重金属超标会对养殖生物造成慢性或急性中毒。
石油类污染物：
对养殖生物的呼吸和摄食产生不良影响。
挥发性酚：
具有毒性，对养殖生物有害。
其他有害化学物质：
如甲基对硫磷、马拉硫磷、乐果、六六六（丙体）、DDT等。
建议养殖者在日常养殖过程中，定期检测上述指标，确保水质安全，为养殖生物提供一个良好的生长环境。
