禁止农田养殖鱼种的原因主要有以下几点：
养殖环境发生改变
环境污染：由于环境污染，农村水源条件遭到破坏，可能不再适合鱼类养殖。
生态要求：国家对养鱼水体排放提出了新要求，大众化的采用人工饲料和化学药物的养殖方式受到规范性限制。
农业生产需求
农药和化肥的使用：稻田需要施肥和打农药以保证水稻的成活率和产量，但农药和化肥的使用会对鱼造成危害，导致鱼死亡。
管理困难：稻田养鱼需要精确控制水量，否则会影响水稻生长和鱼的存活率。此外，管理起来非常麻烦，需要投入大量时间和精力。
经济收益问题
产量低：稻田养鱼的产量相对较低，且受到天气等自然条件的影响较大，成活率不高。
投入产出不成正比：尽管稻田养鱼可以减少农药的使用，但由于产量和销量的问题，农民往往无法获得预期的经济收益。
大规模推广难度
技术要求和操作难度：稻田养鱼需要较高的技术要求和操作难度，农民在实际操作中面临诸多困难。
地域局限性：稻田养鱼模式更适合南方地区，北方地区由于干旱等原因难以普及。
环境和生态问题
农田环境变化：现在的农田环境已经发生了很大变化，清澈的溪水和无污染的土壤减少，化肥和农药的使用对鱼类的生长造成影响。
自然灾害：洪水、干旱等自然灾害频发，对稻田养鱼造成严重威胁。
综上所述，禁止农田养殖鱼种主要是由于养殖环境的变化、农业生产需求、经济收益问题、大规模推广难度以及环境和生态问题等多方面的原因。
