可以水里养殖的菌类包括以下几种：

枯草芽孢杆菌：

这是一种益生菌，能促进水中有益微生物的生长，抑制致病菌，分解有机废弃物，改善水质，增加水中溶解氧含量，提高养殖动物的抗病能力。

地衣芽孢杆菌：

与枯草芽孢杆菌类似，也是一种常见的益生菌，能抑制致病菌的生长，改善水质，促进养殖动物的健康生长。

丁酸梭菌：

产丁酸的益生菌，能提供能量，改善肠道环境，促进消化吸收，增强养殖动物的免疫力，预防和控制肠道疾病。

粪肠球菌：

常见的肠道菌群，在水产养殖中起到促进养殖动物肠道菌群平衡的作用，能抑制有害菌生长，改善肠道环境，增加养殖动物的消化吸收能力。

EM菌：

由多种益生菌组成的混合菌群，具有多种功能，包括改善水质、分解有机废物、促进植物生长、增强养殖动物的免疫力等，广泛应用于水产养殖和农业。

光合细菌：

能利用光能进行不产氧的光合作用，改良水体，对水体中可见光或光能见度较高的水体表层水质具有较好改良效果。

芽孢：

主要是指枯草芽孢杆菌，能降低水体中硝酸盐、亚硝酸盐的含量，改善水质，产生抑制或杀死其他微生物的枯草杆菌素。

乳酸菌：

属于厌氧菌，不耗氧，可以分解小分子有机物，主要用来降低水体中的酸碱度，稳定水体的pH值，提高鱼虾蟹肠道消化酶的活性。

酵母菌：

具有细胞核，属于单细胞真菌类微生物，能黏附在肠道中，刺激鱼虾体内淀粉酶和刷状缘膜酶的分泌，提高动物对食物的利用率，抑制有害菌的生长。

硝化细菌：

可以降解水体中的亚硝酸盐，加速水体中有机物质的分解，减少和避免有机物质沉淀，阻断弧菌与发光菌的营养来源，抑制有害菌的增长。

蛭弧菌：

寄生于其他细菌细胞内并能使其裂解的一类细菌，在水产养殖中用来净化水体，减少水体致病微生物数量，降低鱼虾蟹染病率和控制病害的发生。

这些菌类在水产养殖中各有其独特的作用，可以根据具体需求选择合适的菌种进行养殖。例如，光合细菌和芽孢杆菌主要用于改善水质，乳酸菌用于稳定水体的pH值和增强动物的消化吸收能力，EM菌则是一种综合性的益生菌群，能全面改善水质和生态环境。