养殖公司需要办理以下证件：
土地手续
办理生产设施用地的备案手续，签订用地协议在国土局和农业局备案。
选址需要通过规划局的审批。
环境影响评价（环评手续）
从选址到最终养殖场生产运行整个流程都需要通过环评进行认定和分析预测，需要配套建设污染防治设施。
环评手续需到环保局办理。
排污许可证
在依法实施污染物排放总量控制的区域内，畜禽养殖场必须按规定取得《排污许可证》，并按照《排污许可证》的规定排放污染物。
动物防疫条件合格证
根据《动物防疫法》规定需要办理动物防疫条件合格证。
该证要到畜牧局办理，没有这个证件是不能从事养殖业的。
养殖证
《养殖证》是国家要求海域水产养殖和内陆水域养殖户需要办理的一种证件。
利用海域和内陆水域从事养殖生产活动的单位和个人，必须依法取得《养殖证》。
野生动物驯养繁殖许可证
驯养繁殖野生动物需要办理《国家重点保护野生动物驯养繁殖许可证》。
比如养孔雀、野猪等野生动物的越来越多需要办理这个。
工商登记
具备了上述所需证件后，养殖户就可以去工商局申请工商登记，办理营业执照。
其他可能需要的证件
根据具体养殖类型和规模，可能还需要办理其他相关证件，如《土地规划许可证》、《建设施工许可证》、《生产经营许可证》等。
建议养殖公司在筹备过程中，提前了解并准备好所有必要的证件和手续，以确保养殖业务的合法性和顺利进行。
