肉鸭养殖需要办理的证件包括：
动物防疫条件合格证：
这是开办动物饲养场、养殖小区、动物隔离场所、动物屠宰加工场以及动物和动物产品无害化处理场等生产经营活动的前提条件，需经兽医管理部门审查符合动物疫病预防、控制、扑灭等条件后批准发放。
养殖许可证：
在养殖场注册后，需要向当地农业部门申请养殖许可证，申请时需要提供养殖场注册证明、养殖计划、饲料采购证明等材料。
环保手续：
包括排污许可证等，养殖场在建设和运营过程中需要按照环保要求进行粪便处理和污水处理，并接受环保部门的监管。
工商登记证：
在取得上述证件后，需要到当地工商局办理工商登记手续，取得营业执照。
税务登记证：
此外，还需到税务局办理税务登记。
土地使用证明：
需要向当地土地部门咨询养殖场占地的性质，并办理相应的土地备案手续。
兽医证：
如果养殖规模较大，可能还需要配备兽医证。
生产设施用地备案手续：
需要签订用地协议并在国土局和农业局备案。
环评手续：
整个养殖流程需要通过环评进行认定和分析预测，并配套建设污染防治设施，最终获得环评批复手续。
经营许可证：
如果是种畜禽养殖，还需要办理经营许可证，该证需经省级畜牧行政主管部门审核同意后，报农业部核定。
建议在具体办理过程中，与当地相关部门详细咨询，确保所有手续齐全、合规。
