小龙虾养殖中常用的菌种包括以下几种：
光合菌：
光合菌通过光合作用分解水体中的氨氮和亚硝酸盐，合成有机氮化物，从而改善底质和净化水质。它们在气温不是很高的情况下效果最佳，尤其在春季和秋季，可以提高小龙虾的免疫力。
酵母菌：
酵母菌适宜在酸性环境中生存，温度在18℃到30℃之间，在春夏秋季保持活跃。它们可以通过繁殖与有害菌竞争空间和营养，从而减少有害菌的数量，并提高小龙虾的肠胃消化能力。
EM菌：
EM菌（Effective Microorganisms）是一种复合菌群，包含多种有益微生物，如乳酸菌、酵母菌、放线菌等。它们能分解有机物、提供营养、抑制病菌、调节pH值，促进小龙虾塘的生态平衡，提高水质，减少病害。
硝化细菌：
硝化细菌能够降解亚硝酸盐，加速水体中有机废物的分解和氧化，减少有机废物的沉淀，并阻断有害菌的营养来源，从而抑制有害菌的增长。
芽孢杆菌：
芽孢杆菌具有强大的净水能力，可以抑制有害藻类的生长，对老水、黑水等异常水有较好的调节作用，并能有效分解池塘底部的有机废物，维持良好的池塘底部环境。
建议
光合菌和 酵母菌在春季和秋季使用效果最佳，可以提高免疫力和水质净化。
EM菌适合在全年使用，能够全面改善水质和生态环境。
硝化细菌和 芽孢杆菌在养殖过程中可以随时使用，以保持水质稳定和抑制有害生物。
根据具体养殖情况和需求，可以选择适合的菌种进行使用，以达到最佳的养殖效果。
