养殖羊的申请流程如下：

申请规模化畜禽养殖项目

个人或企业需要经过乡（镇）人民政府的同意，向县级畜牧主管部门提出规模化养殖项目申请，进行审核备案。

用地备案手续

规模化畜禽养殖用地需以转包、出租等合法方式取得，并需办理用地备案手续。农村集体经济组织、农民和畜牧业合作经济组织在申请时，经县级畜牧主管部门审核同意后，乡（镇）国土所会帮助协调用地选址，并到县级国土资源管理部门办理用地备案手续。

办理《动物防疫条件合格证》

选址和布局需符合动物防疫要求，生产区与生活区要分开。畜禽舍设计、建筑需符合动物防疫要求，具备采光、通风和污物、污水排放设备，生产清洁道和污染道要分设。只有取得该合格证后，才能进行大规模养殖。

办理养殖许可证

需要提供土地养殖设施用地证明，由当地县级以上政府审批发放。还需办理动检证，条件包括养殖场要有消毒通道、净道和污道布局严格区分等。之后可以到工商部门核名。

环保评估和备案

养殖场需要到环保局办理环保评估，通过环保部门的考察后，方可进行养殖。同时，还需进行立案备案手续。

办理生产经营许可证和野生动物驯养繁殖许可证

在取得动物防疫条件合格证后，需要到畜牧局办理生产经营许可证，然后到工商局办理登记手续。如果是特种养殖，还需到省级畜牧行政主管部门审核同意后，再报农业部门核定。

申请补贴

养羊的农民可以向当地畜牧部门申请补贴，补贴数额根据养殖数量确定。申请时需提供相关证明材料。

建议：

在申请过程中，建议与当地政府及相关部门保持良好沟通，确保所有手续和证件都能顺利办理。

严格按照相关法规进行养殖场的建设和管理，确保养殖活动合法合规。