在雨天养殖黑木耳时，可以采取以下措施：
挖好沟系，及时排水
在菌床周围挖出低于菌床的排水沟，以利于菌床通气、菌丝生长，防止因雨水浸泡影响黑木耳的正常生长。
盖好拱棚，防止雨水
拱棚棚膜只盖在顶部，周边要利于通风，避免雨水对畦面或菌棒的直接冲击，防止长时间滴水造成菌棒腐烂、变质。
防治病虫，适时用药
长时间的潮湿天气易引起霉菌等病虫害的发生，应及时采取措施进行防治。可以用浓石灰水冲洗抑制杂菌，或用75%的酒精消毒，或用少量的绿霉净进行局部处理消毒。对于线虫、蛞蝓等害虫，可以在菌床周围撒一些石灰粉，减少虫害的发生或抑制虫害的爬行移动，也可人工捕捉或用50%的食用盐水或5%的碱水滴杀。尽量减少化学农药的使用，以减少对食用菌和环境的污染。
适时收获
在持续降雨天气下，应及时采收已经成熟的黑木耳，避免因长时间浸泡在水中而影响质量和产量。
过水后的管理
对于已经灭菌、待接种的菌棒，应提前做好防雨过水准备。如果菌棒被水浸泡，不应冒险接种，而应重新灭菌后再接种。对于过水冲击的正在出菇的露地栽培黑木耳，收集后应执行换茬管理，干燥放置三至五天以修养菌丝的活力，然后再恢复水分管理。一般淋雨或低程度过水（未长时间浸泡）对发好菌的耳袋整体产量不会有太大影响。
保持培养基的湿度和通风
在种植过程中，要保持培养基的湿度和通风，避免过于潮湿和过于干燥。特别是在连续降雨天气下，更应注意保持菌袋的干燥，可以通过加大通风来调节湿度。
防讯准备
料场和库房应提前做好防讯准备，受潮的栽培原料应在雨后晴天及时摊晒，避免竞争性杂菌滋生。大暴雨前应及时采收适采的黑木耳，水过后要消除积水，坚持干干湿湿的原则（三干七湿），并加大通风。
通过以上措施，可以在雨天有效地养殖黑木耳，保证其优质稳产。
