建设养殖棚需要按照以下步骤和程序进行申请：

养殖用地证明

到国土资源局办理，确保用地符合养殖要求。

环评手续

到环保局办理，环保部门会考察养殖场的排污情况，合格后可取得环保证明。

规划意见

设计好养殖场的建设图纸，然后到规划局审核。

立案备案手续

到发改委办理，建议与村委会一同前往。

动物防疫条件合格证

在畜牧局办理，防疫条件合格的养殖场可以取得此证。

养殖场备案登记手续

到畜牧局办理，完成登记手续。

生产经营许可证

先由村委会证明，然后到畜牧局审核，最后到工商局办理。

野生动物驯养繁殖许可证 （如适用）：

在取得生产经营许可证后，到畜牧局办理检疫证，再到林业局办理。

土地流转合同

与村里或土地经营者签订土地流转合同，确定养殖用地的性质及范围。

养殖项目申请

向当地政府提出养殖项目申请，政府工作人员会实地勘察并出具同意养殖项目的批复意见和适养区证明。

建设指标申请

经过县农委立项后，向国土部门申请建设指标，国土部门核准后出具证明，可能需要缴纳复耕保证金。

环保手续

向环保和检疫部门申请办理环保手续和动物防疫条件合格证，这两证非常重要，无证建设存在较大风险。

工商登记

办理工商登记，取得营业执照，确立养殖场的市场主体地位。

税务登记

持营业执照及财务制度到税务局办理税务登记证。

其他可能手续

根据具体情况，可能还需要办理其他相关手续，如农业用地转建设用地的审批手续、缴纳使用费和造地费等。

建议你在办理这些手续时，详细咨询当地相关部门，确保所有步骤和文件都符合法规要求，以顺利推进养殖棚的建设。