生猪养殖环保备案的流程如下：

备案申请

申请人向所在地县（市、区）行政服务中心提交申请材料，或在浙江政务服务网进行网上申报。

资料审查

（市、区）行政服务中心在收到材料后2个工作日内完成形式审查和受理工作，受理后将全部申请材料转送所在地县（市、区）农业农村部门。

核查备案

所在地县（市、区）农业农村部门在收到材料后组织专家进行技术评审，除技术评审和企业整改时间外，8个工作日内作出是否准予备案的决定。

备案登记

所在地县（市、区）农业农村部门在作出决定后5个工作日内，市县级畜牧兽医行政主管部门应当将获准备案的畜禽养殖场名称、养殖地址、畜禽品种和养殖规模等按规范格式进行登记，通过邮寄或现场发放畜禽养殖代码。养殖代码由市县级畜牧兽医行政主管部门按照备案顺序统一编号，每个养殖场只有1个养殖代码。养殖代码由6位县（市、区）行政区域代码和4位顺序号组成，作为养殖档案编号。

环保手续

需要委托有资质的环评公司编写环评报告，然后送环保局进行委托评审，获得批文。

年出栏量5000头以上的或涉及环境敏感区域的生猪养殖项目，要编制环境影响评价报告书，并经生态环境部门审批；其余生猪养殖项目，要办理环评备案。

动物防疫条件合格证

向所在地县级农业农村部门提出申请，提交相关材料，审查合格的，颁发《动物防疫条件合格证》。

其他手续

办理营业执照，兴办小型养猪场的，要到当地工商局办理工商登记预核手续（场名预核），然后再进行办理企业或个体工商户《营业执照》。

到当地畜牧部门办理养猪项目备案手续。

建议：

在进行生猪养殖环保备案前，建议详细咨询当地农业农村部门或相关机构，确保所有手续和材料符合要求，避免因手续不全导致备案失败。