养殖厂房的审批流程如下：

提出申请

向建设所在地的乡镇政府提出申请，并了解拟建养殖场的用地性质，确保用地不占用基本农田，不破坏种植条件，并远离河流和饮用水源区域及村庄。

资料审查及审批

乡镇政府收到申请后，会根据设施农用地管理规定对提交的资料进行审查。如果资料符合要求，乡镇政府会牵头会同区县的国土、畜牧、农业、环保等相关部门对养殖场的用地进行踏勘。踏勘后符合相关规定要求的，乡镇政府会向区县级政府进行报审，由县级政府进行审批。

批准建设

区县政府收到相关资料后，会按相关规定核实并进行批复。批复下来后，国土部门组织相关部门对场地设计进行审查，如果符合设计要求，就可以颁发设施农用地备案通知书，养殖者便可以开始建设。后续还需办理相关养殖手续。

环保手续

从选址到最终养殖场生产运行整个流程都需要通过环评进行认定和分析预测，需要配套建设污染防治设施。环评手续需到环保局办理，包括提交相关材料、公示、申请受理、审查等环节，最终获得排污许可证。

其他手续

办理工商登记，并办理养殖场备案登记手续。需要携带个人申请、村镇证明、养殖备案手续到国土所申请办理养殖用地备案手续，国土所进行现场测量，出具地类、规划等证明，签订土地复耕协议书，并报国土局审查备案。

办理动物防疫条件合格证，持单位法人身份证及相关行业营业执照到当地动物检疫检验局办理。

根据养殖场的经营范围和规模，可能还需要办理其他相关许可证和证明文件，如税务登记证等。

建议：

在申请过程中，建议提前了解当地的相关政策和法规，确保所有手续和材料符合要求，避免因不符合规定而被驳回。

养殖场的选址应充分考虑环境、交通、供水等因素，确保养殖活动的顺利进行和环境保护。