在水产养殖中，常用的菌种包括以下几种：

枯草芽孢杆菌：

这是一种益生菌，能促进水中有益微生物的生长，抑制致病菌，分解有机废弃物，改善水质，增加水中溶解氧含量，提高养殖动物的抗病能力。

地衣芽孢杆菌：

与枯草芽孢杆菌类似，也是一种常见的益生菌，能抑制致病菌的生长，改善水质，促进养殖动物的健康生长。

丁酸梭菌：

产丁酸的益生菌，能提供能量，改善肠道环境，促进消化吸收，增强养殖动物的免疫力，预防和控制肠道疾病。

粪肠球菌：

促进养殖动物肠道菌群平衡，抑制有害菌生长，改善肠道环境，增加养殖动物的消化吸收能力。

EM菌：

由多种益生菌组成的混合菌群，具有改善水质、分解有机废物、促进植物生长、增强养殖动物免疫力等多种功能，广泛应用于水产养殖和农业。

乳酸菌：

用于分解大分子有机物和改善肠道，降低水体黏度，减少氨氮、亚盐和硫化氢的产生，内服可调理肠道，促进营养物质的消化吸收，补充营养。

光合细菌：

简称PSB，能利用光合作用分解小分子有机物，处理氨氮、亚硝酸盐、硫化氢等，增强水体光合作用，治理绿色水质，抑制有害藻类生长。

硝化细菌：

自养型菌种，主要作用是降低水体中的氨氮和亚硝酸盐。

蛭弧菌：

具有抑制或杀死其他微生物的作用，可用于改善水质和抑制病原微生物。

这些菌种在水产养殖中各有其独特的作用，可以根据不同的养殖需求和水质状况选择合适的菌种进行使用。例如，光合细菌适合在光照充足的情况下使用，而乳酸菌和EM菌则适合在养殖全程中使用，以维护水质稳定和促进动物健康。