功能食品原料种类繁多，主要包括以下几类：
常见食品原料
小麦
燕麦
玉米
初乳
胡萝卜等
动植物组织
鱼头
骨头
脂肪等
传统中药
灵芝
虫草
枸杞
甘草
杜仲
人参等
益生菌
嗜酸乳杆菌
双歧杆菌
鼠李糖乳酪杆菌
罗伊氏乳杆菌
干酪乳杆菌
格式乳杆菌等
蛋白质类活性物质
免疫球蛋白
乳铁蛋白
低聚肽等
自由基清除剂
维生素E
维生素C
β-胡萝卜素
硒
超氧化物歧化酶（SOD）
谷胱甘肽
辅酶Q类
儿茶素
原花青素等
矿物质
常量元素：钙、磷、钾、钠、氯、镁、硫（硫辛酸）
微量元素：碘、硒、铜、钼、铬、铁、钴等
油脂类
DHA
EPA
磷脂
亚麻酸
亚油酸等
糖类
功能性低聚糖类：如水苏糖、低聚果糖、低聚木糖、低聚半乳糖、低聚异麦芽糖、大豆低聚糖、低聚壳聚糖等
药食同源类食材
丁香、八角茴香、刀豆、小茴香、小蓟、山药、山楂、马齿苋、乌梢蛇、乌梅、木瓜、火麻仁、代代花、玉竹、甘草、白芷、白果、白扁豆、白扁豆花、龙眼肉（桂圆）、决明子、百合、肉豆蔻、肉桂、余甘子、佛手、挥发油、姜黄素等
其他
透明质酸钠（玻尿酸）
γ-氨基丁酸（GABA）
苦荞麦黄酮、儿茶素、苦荞多酚、植物甾醇、荞麦碱
魔芋中的葡甘聚糖
山药中的薯蓣皂苷、山药多糖等
这些原料通过不同的组合和加工方式，可以制成具有各种健康功效的功能食品，满足消费者对健康饮食的需求。
