如果在食品中发现了苍蝇，可以采取以下措施来处理：
与经营者协商
首先，消费者应该与餐厅经营者进行协商，要求赔偿损失，并支付价款十倍的赔偿金。如果协商不成功，可以采取其他措施。
投诉举报
如果与经营者协商不成，消费者可以向食品药品监督局、工商局、消费者协会等进行投诉举报。这些部门会对店家进行调查，并可能采取没收违法所得、处以罚款等处罚措施，以维护消费者的合法权益。
法律途径
消费者还可以通过法律途径解决问题，包括向法院提起诉讼。根据《食品安全法》第一百四十八条，消费者因不符合食品安全标准的食品受到损害的，可以向经营者要求赔偿损失，也可以向生产者要求赔偿损失。消费者可以要求支付价款十倍或者损失三倍的赔偿金，增加赔偿的金额不足一千元的，为一千元。
保留证据
在处理此类问题时，消费者应保留相关证据，如实物样品、照片、就餐发票等，以便在投诉或诉讼过程中使用。
寻求第三方调解
消费者还可以寻求消费者保护协会或其他调解组织的帮助，通过他们的专业调解来解决问题。
预防措施
此外，餐厅方面也应采取必要的预防措施，如定期清洁、使用密封容器、安装纱窗和门帘等，以防止苍蝇滋生。
通过以上措施，消费者可以有效维护自己的合法权益，并促使餐厅改善卫生条件，保障食品安全。
