处理不干净的食品可以采取以下几种方法：

剔除污染部分

将受污染和未受污染的部分分开，防止交叉污染。

在卸货时分开堆放，仔细检查确认无污染的部分后，可供食用。

稀释处理

对于经济价值高、数量多的被污染食物，可以通过稀释处理，使有害物质含量降至国家标准允许范围或机体可接受程度，继续供食用。

有限食用

在供应销售时加以限制，例如只允许作为一次性或短期销售。

去除污染物

通过一定方法去除食物中的污染物，恢复其利用价值，这是较为理想的处理方式。

改作他用或销毁

对于无法通过上述方法处理的不合格食品，可以改作他用或进行销毁处理。

对症治疗

如果因食用不干净食品出现明显症状，如头痛、头晕、腹痛、腹泻、呼吸困难等，应及时就医并进行对症治疗。例如，使用阿托品控制呕吐，奥美拉唑缓解胃痛和胀气，蒙脱石散治疗腹泻，依巴斯汀缓解过敏症状，医生可能会提供抗感染治疗如诺氟沙星等。

密切观察

如果进食了少量不干净的食物且毒性较小，没有引起身体不适，应多喝水以促进新陈代谢，并密切观察身体状态。

建立追溯制度

食品生产经营者应建立不合格食品追溯制度，对原辅料、辅助材料、半成品和成品进行检测、记录、追溯和处理，确保食品安全。

销毁处理流程

对于不合格食品，应咨询专业报废产品销毁中心，提供报废清单及销毁程度要求，制定综合处理方案，并在全程监督下进行销毁，确保销毁数量及满意程度。

生物处理工艺

对于食品加工废水，可以采用生物处理工艺，如好氧生物处理（包括活性污泥法和生物膜法）和厌氧生物处理（如UASB反应器），将有机物氧化分解为无毒稳定的无机物，从而去除废水中的污染物。

根据具体情况选择合适的处理方法，确保食品安全，避免对人体健康造成危害。