预包装食品公司的运作流程主要包括以下几个步骤：

审验供货商资格

向供货单位索取加盖企业印章的有效的《食品流通许可证》、《食品生产许可证》、《营业执照》和产品合格等证明文件。

验明产品合格的证明文件，例如查验产品出厂合格证、产品检验检疫报告等。

验明产品标识，例如生产日期、保质期等。

建立并登记购（销）台账

建立食品进货台账和销货台账，如实记录食品的名称、规格、数量、生产批号、保质期、供货者名称及联系方式、进（销）货日期等内容。

台账的保存期限不得少于2年。

食品采购与检查

在购进食品之后，清点、检查产品，查看是否破损、变质、发霉等情况。

及时分类装订存档，将供货商提供的相关证明文件分类装订成册存档。

不合格食品处理

对于不合格的食品，需要进行销毁处理或退回供货商。

合格的食品则可以上货架销售。

销售与服务

在销售食品时，需要按规定做好售后服务，接收消费者投诉。

将各类食品成分分开摆放，按品种分类，并按食品标签标明的温度贮存、保管食品。

食品储存与卫生

各类食品成品应按品种、进库日期分类，分开存放，离地不少于20-30厘米，离墙不少于30厘米。

每天对店面卫生检查一次，确保店面通风良好、干净整洁，符合食品储存要求。

从业人员健康检查

食品从业人员每年应当进行健康检查，取得健康证明后方可参加工作。

食品安全信息公示

按照《食品安全信息公示制度》的要求，公示经销食品的安全信息，确保经销食品安全信息准确、有效。

发现食品安全不稳定因素的，及时向有关部门报告，并立即停止销售。

通过以上流程，预包装食品公司可以确保食品的安全性和合规性，同时提供优质的客户服务，从而在竞争激烈的市场中取得成功。