食品工厂一般采用以下几种方法进行杀菌：

超高压杀菌技术

食品物料在包装完好后，放入液体介质（如食用油、甘油、油与水的乳液）中，在100~1000 MPa压力下作用一定时间，以达到灭菌要求。

低温杀菌

通过较低温度的加热方法对食品中的微生物进行部分杀菌，通常在低于水沸点温度下进行。

巴氏杀菌法

一种较低温度的热处理方式，一般在低于水沸点温度下进行，用于杀灭部分致病微生物，同时尽量保持食品的营养和风味。

超高温瞬间杀菌（UHT杀菌）

加热温度为125~150℃，加热时间2~8秒，使产品达到商业无菌要求的杀菌过程。

微波杀菌

利用微波处理食品，使食品中的微生物丧失活力或死亡，从而达到延长保存期的目的。

紫外线杀菌

利用紫外线灯对生产车间、更衣室、卫生间等区域进行消毒，紫外线能够破坏细菌和病毒的DNA结构，从而达到杀菌效果。

臭氧杀菌

臭氧在水中部分溶解，具有强氧化性，能有效杀灭多种细菌和病毒。食品工厂中可以使用臭氧发生器对生产车间、仓库、包装区域等进行消毒。

化学消毒

使用化学消毒剂（如奥克泰士消毒剂）进行喷洒消毒，或使用喷雾设备进行操作，作用完毕后分解为氧气和水，不会留下残留物。

蒸汽消毒

使用蒸汽发生器对生产设备、工器具、工作台等进行高温消毒，优点是消毒彻底且无残留。

辐射消毒

包括紫外线消毒和电离辐射消毒，利用辐射能穿透物品，杀死其中的微生物。

这些方法各有优缺点，食品工厂通常会根据产品特性、生产环境和卫生要求选择合适的杀菌方法。在实际应用中，可能会结合多种消毒方法以达到最佳的杀菌效果和食品安全。