食品安全问题主要涉及以下几个方面：

微生物性危害：

包括细菌、病毒、霉菌等微生物污染，这些微生物可能对人体健康造成严重影响，如沙门氏菌、大肠杆菌等。

化学性危害：

涉及农药残留、重金属污染、添加剂过量等化学物质，这些物质对人体健康的影响具有长期性和潜伏性。

生物毒素：

包括一些天然毒素或由微生物产生的毒素，这些毒素可能存在于某些食品中，对人体健康构成威胁。

食品掺假和基因工程食品的安全性问题：

涉及在食品中掺入非食品原料、使用未经批准的添加剂或基因工程技术改造食品，这些问题可能带来未知的健康风险。

食品添加剂问题：

包括过量添加食品添加剂或使用国家明令禁止添加的物质，这些问题影响食品的质量和安全性。

食品原材料安全控制：

农产品种植养殖过程中使用农药、化肥、兽药等，可能导致食品原材料中有害物质残留。

食品加工、存储或运输不当：

这些问题可能导致食品发生腐败变质或受到微生物污染。

食品安全标准体系滞后：

我国的食品标准与实际需要和国际标准相比还有较大差距，影响了食品安全监管的有效性。

检测水平低：

食品安全检验检测机构稀缺，导致食品安全监督力度和震慑力不足。

食品流通环节经营秩序不规范：

包括食品经营企业规模小、管理混乱、溯源管理难等问题，以及部分企业在食品收购、储藏和运输过程中滥用防腐剂、保鲜剂。

食品安全保障队伍素质有待提高：

食品生产、经营与管理机构中缺乏具备专业知识的技术人员，无法有效制定和执行食品安全法规、标准。

综上所述，食品安全问题是一个复杂的系统性问题，涉及食品生产、加工、流通、消费等各个环节。解决食品安全问题需要从多个层面入手，包括完善法律法规、加强监管、提高检测水平、规范经营秩序、提升从业人员素质等。