宠物食品生产企业需要办理以下许可：

工商部门营业执照

这是开展任何商业活动的基础证件，也是合法经营的必备证明。

在申请营业执照时，需要提供公司的基本信息、业务范围、注册资本等相关资料，并通过工商行政管理部门的审核。

卫生部门食品经营许可证或食品生产许可证

由于宠物食品属于食品范畴，因此需要取得食品经营许可证或食品生产许可证。

这一证件证明了宠物食品的生产或销售过程符合食品安全标准。

在申请时，需要提交营业执照、食品生产或销售的相关资料，并通过食品药品监督管理部门的现场核查。

卫生许可证

宠物食品的生产或销售场所需要满足一定的卫生条件，因此需要申请卫生许可证。

这一证件证明了经营场所的卫生状况符合相关要求。

在申请时，需要提交经营场所的卫生设施、消毒记录等材料，并通过卫生行政部门的审查。

防疫部门动物防疫条件合格证

为确保宠物食品的安全生产，需要具备动物防疫条件合格证。

这一证件证明了宠物食品的生产或销售场所在防疫工作方面符合要求。

在申请时，需要提交防疫设施、防疫措施等相关资料，并通过动物卫生监督机构的审查。

饲料生产许可证（仅适用于生产宠物配合饲料和宠物添加剂预混合饲料的企业）：

向生产地省级人民政府饲料管理部门提出申请，并依法取得饲料生产许可证。

生产许可证有效期为5年，有效期满需要继续生产的，应当在有效期届满6个月前申请续展。

综上所述，宠物食品生产企业需要办理工商部门营业执照、卫生部门食品经营许可证或食品生产许可证、卫生许可证和防疫部门动物防疫条件合格证。生产宠物配合饲料和宠物添加剂预混合饲料的企业还需办理饲料生产许可证。