食品加工需要申请的证件主要包括以下几项：
营业执照：
这是合法经营的必要前提，需要到当地工商行政管理局或所申请。
食品生产许可证：
这是国家质量监督检验检疫总局颁发的许可证，证明企业具有生产加工食品的能力和资格。申请时需要提供厂房、设备、环境等相关证明材料。
食品流通许可证：
如果食品加工厂涉及食品的销售，需要办理食品流通许可证。
健康证明：
所有直接接触食品的工作人员，如厨师、卫生清洁员等，必须每年进行健康检查并持有当年的健康证。
税务登记证：
需要提供工商营业执照、法定代表人身份证、税务登记表等资料到当地税务机关办理。
环保审批和消防备案：
需要进行环保审批和消防备案等程序，确保生产活动符合环保和消防安全要求。
食品安全管理体系认证：
根据食品安全法规定，食品加工企业需要建立食品安全管理体系并获得认证。
其他可能的证件：
根据实际需要，可能还需要办理其他相关的许可和证书，如消防安全证书、环保许可证等。
综上所述，食品加工企业需要办理的证件包括营业执照、食品生产许可证、食品流通许可证、健康证明、税务登记证、环保审批和消防备案，以及食品安全管理体系认证等。建议企业按照相关法律法规的要求，逐一办理这些证件，以确保合法合规经营。
