食品创新面临的难题主要包括以下几个方面：

法规遵从与安全性压力

政府对食品安全和营养标准的法规政策日益严格，食品企业必须在产品创新的同时确保所有新产品符合最新的法规要求，这增加了研发的复杂性和成本。

研发投入与风险平衡

食品企业为了保持竞争力，需要不断投入大量资源进行产品研发，但高昂的研发成本与研发成果的不确定性之间存在矛盾，研发失败或长时间无回报可能会给企业带来财务压力。

人才短缺与创新能力不足

食品行业在创新型人才方面存在缺口，尤其是既懂食品科学又熟悉市场趋势的复合型人才。这种短缺限制了企业在新产品开发、配方改良及工艺创新方面的速度和效果。

供应链管理薄弱

企业与供应商、客户之间的协同能力不足，导致供应链响应速度慢、效率低下。这增加了产品从研发到上市的时间和成本。

信息不对称与效率低下

传统食品企业在产品研发、生产、销售等环节中存在信息不对称的问题，导致决策效率低下，难以快速响应市场变化。

特殊食品核心原料依赖进口

国内市场被国际巨头瓜分，国内企业尚不具备参与国际竞争的能力，较为集中的问题包括特殊食品核心原料严重依赖进口。

技术和标准缺失

大量的功能食品和配料缺少验证评价标准，无法取得应有的市场地位。此外，食品科技推动产业链融合实现可持续发展的核心算法等关键技术难题也制约了行业发展。

环境污染与资源紧张

随着全球人口的增长，对食物的需求也在不断上升。食品科技创新有助于提高粮食产量，满足人们日益增长的食物需求，同时减少对环境的负面影响，实现可持续发展。

公众接受度

新技术的引入需要公众的广泛接受，这在一定程度上限制了食品创新的步伐。

技术成本高

食品科技创新涉及的技术成本较高，这在一定程度上制约了企业的研发能力和市场推广。

综上所述，食品创新面临多方面的难题，需要企业、政府和社会各界共同努力，通过技术创新、人才培养、政策支持和市场开拓等手段，推动食品行业的持续健康发展。