转基因食品可能存在的问题主要包括以下几个方面：

加重消化道的负担：

转基因食品在加工过程中，由于基因的导入，可能会导致消化道的负担过重。

诱发过敏反应：

有些过敏体质的人群服用后，可能会出现一系列的过敏反应，通常会导致皮肤红肿、瘙痒等。

导致营养不均衡：

转基因食品的自身营养价值可能会受到破坏，经常食用便会影响营养的摄入，导致营养结构失衡。

产生毒性：

转基因食物可能会产生毒性，主要是来源于食物专用的农药，这些农药毒性很大，食用后毒素会存留在体内，长时间会对身体造成伤害。

引发疾病：

经常食用或者摄入转基因食物过多，会导致身体出现疾病，比如胃肠道疾病、神经系统疾病等。

产生耐药性：

经常食用转基因食品，会使人体对现有的药物产生耐药性，这样会使药物的作用减弱或者产生耐药性。

超级杂草问题：

如果转基因高产作物通过花粉导入方式将高产基因传给周围杂草，会引发超级杂草出现，对天然森林造成基因污染和对这些地区的其他物种带来不可预见的后果。

基因转移：

转基因植物可能与野生植物杂交，导致转基因物质传播到自然环境中，从而对生态系统产生不利影响。

抗药性和超级杂草：

使用转基因作物产生的抗除草剂或杀虫剂可能导致一些害虫或杂草产生抗药性，从而带来农业可持续性的问题。

需要注意的是，虽然存在上述潜在问题，但目前没有足够的科学证据表明转基因食品直接导致人类健康问题。然而，一些研究表明转基因食品可能对人体健康产生潜在影响，因此仍需要进一步的研究和监测。建议消费者在食用转基因食品时保持谨慎，并关注相关研究和报道。