石油从地层中出来主要经历以下几个步骤：

生物沉积与成岩作用

石油是由古代生物残骸在地下经过长时间的高压、高温条件，在微生物的作用下逐渐腐烂并转化而来的。这些生物残骸可以是海洋中的海藻、浮游动物，也可以是陆地上的植物和动物。它们沉积在海底或湖底，逐渐被泥沙覆盖，形成富含有机质的泥浆。在缺氧的环境下，特殊的细菌如厌气性细菌会分解这些有机质，生成富含烷烃和芳香烃的有机淤泥。

地质作用与油气聚集

随着地壳的升降，沉积物不断加厚，有机淤泥在缺氧、高温、高压的条件下发生复杂的化学变化，逐渐转化为石油和天然气。这些石油和天然气在地下岩石的孔隙和裂缝中聚集，形成含油气层。在地质过程中，这些含油气层可能会因为地壳运动而抬升，最终露出地表或被钻探设备发现。

钻井与采油

确定石油的位置和分布后，科学家会进行钻井，通过钻探设备将井钻到含油气层。如果地层压力足够大，石油可能会自喷出来；如果压力不够，就需要使用泵（如无杆泵或有杆泵）从地层中抽出石油。常见的采油方式包括自然采油、压裂和注水采油等。自然采油是利用地下压力将石油推出井口；压裂技术是通过注入高压流体来分解岩石，使石油更容易流出；注水采油则是通过向储层注入水来增加压力，使石油更容易从井口流出。

总结起来，石油从地层中出来主要经历生物沉积与成岩、地质作用与油气聚集、钻井与采油等过程。这些过程共同作用，使得石油能够在地下岩石的孔隙中形成并聚集，最终通过钻井和采油技术被人类开采利用。