新疆石油的管理归属历经了多次变更，具体如下：
中国石油天然气集团公司
新疆石油管理局最初隶属于中国石油天然气集团公司，主要负责石油及天然气的钻井、录井、测井、试油、井下作业等钻采工程技术服务，以及低效油田开发、工程建设施工、机械制造、公路运输、发供电、给排水、通信等业务。
1998年9月，中国石油天然气集团公司成立后，新疆石油管理局成为其下属企业，并接受集团公司和新疆维吾尔自治区的双重领导。
中国石油化工股份有限公司
2009年12月，中国石油化工集团公司对原西北新疆分公司进行了管理体制调整，新成立了中国石油化工股份有限公司新疆石油分公司，直接归属于中国石化领导，并于2010年1月1日正式运行。
中国石油天然气股份有限公司
新疆油田公司是中国西部最大的石油生产企业，隶属于中国石油天然气股份有限公司。其前身为1950年成立的中苏石油股份公司，1955年交中方独资经营，后改称新疆石油管理局。1999年7月，中国石油天然气集团公司批准，成立了中国石油新疆油田分公司，并于2000年1月1日起与新疆石油管理正式分开分立。
综上所述，新疆石油目前的管理归属主要是中国石油天然气股份有限公司，具体运营由中国石油新疆油田公司负责。
