石油生物证据主要包括以下几种：
旋光性
石油馏分具有旋光性，过去曾被认为是生物有机物质的特有属性。然而，近几十年的研究表明，人工合成的很多物质也具有旋光性，因此旋光性不能作为石油由生物降解演化而来的决定性证据。
生物成因标志物
石油中发现有生物成因标志的有机化合物，如卟啉、姥鲛烷、植烷和甾烷等。这些化合物过去被认为是生物特有的，但近十几年的研究发现，陨石中和地幔捕虏体中也有这些化合物，说明它们并非生命所独有。
沉积坳陷环境
世界上99%已发现的油气田都分布在富含生物化石和有机物的沉积坳陷环境中。这种分布确实表明石油可能来源于生物沉积，但并不一定能直接推导出石油来自于生物化石的沉积与演变。
干酪根热降解模型
实验室证明，地下的干酪根可以生成油气，这是石油有机成因说的一个重要支柱。
微生物活动
研究发现，一些微生物的存在与石油的分布有一定的关联。例如，硫酸盐还原菌等微生物在石油油层水中被发现，这些微生物在烃类的形成、转化和开发过程中起着重要作用。
地质构造与地幔活动
地质构造的研究表明，沉积坳陷的原因是上地幔的隆起，地幔中的无机物可以通过软流层进入盆地等坳陷中，形成油气藏。
综合以上证据，虽然石油的生物成因说仍有一定的支持，但目前的科学研究已经对某些传统证据提出了质疑，并提出了新的解释和观点。因此，石油的生物成因仍然是一个需要进一步研究和探讨的领域。
