南京的石油加工厂包括以下几家：

南京炼油厂

成立于1958年，1965年5月建成投产，年加工原油能力23.7万吨，主要产品包括汽油、煤油、柴油等。

南京烷基苯厂

1976年10月2日动工建设，1982年3月建成投产，年生产能力为5万吨，是全国最大的洗涤原料厂。

长江石油化工厂

历史可追溯至1953年9月，是南京地区最早的一家石化企业，主要产品包括润滑油、防锈油、凡士林等特种油品。

钟山化工厂

以石油裂解气为原料，生产表面活性剂的专业化工厂。

扬子石油化工股份有限公司

位于南京江北的六合区葛塘，年加工能力一千五百万吨原油。

金陵石油化工股份有限公司

位于南京江南栖霞区，年加工能力二千万吨原油。

南京旭峰化工厂

属于南京石化企业之一。

南京环洋化工有限公司

属于南京石化企业之一。

南京帝斯曼东方化工有限公司

属于南京石化企业之一。

南京海蓝化工厂

属于南京石化企业之一。

南京宗宇石油化工有限公司

属于南京石化企业之一。

南京苏陵化工有限公司

属于南京石化企业之一。

南京龙溪化工有限公司

属于南京石化企业之一。

中国石化股份有限公司金陵分公司

位于南京市东北郊栖霞区，主要从事石油炼制及石化产品的加工生产和销售，产品远销多个国家和地区。

南京东方石油化工厂

成立于1990年，主要产品包括石油化工。

南京炼油厂有限责任公司

成立于2007年12月19日，是南京炼油厂旗下的企业。

这些企业涵盖了从原油加工到石化产品生产的各个环节，构成了南京地区较为完整的石油加工产业链。