垄断石油赔钱的原因是多方面的，主要包括以下几点：

成本因素

资源获取成本：石油行业的勘探和开采成本极高，特别是在复杂的地质条件下，寻找和开采石油需要投入大量的技术、人力和资金。随着易开采资源的逐渐减少，开发难度不断增大，成本也随之上升。

运营管理成本：这些垄断部门通常规模庞大，人员众多，管理成本较高。从高层管理人员到基层员工，工资、福利、培训等费用都是一笔不小的开支。同时，为了保证企业的正常运转，还需要投入大量资金进行信息化建设、风险管理、安全保障等方面的工作。

社会责任成本

石油行业要保障国家能源安全，在国际油价波动剧烈的情况下，为了稳定国内市场，可能不得不采取一些价格调控措施，这就可能导致利润受损。

市场定价机制

国内油价定价机制不合理，导致垄断企业在赚钱迫切性的驱使下，可能通过不合理的方式提高价格，进而影响其盈利能力。

国企管理问题

国企存在不健康风险和管理混乱的问题，如高薪高福利待遇、管理成本过高等，这些问题也会影响企业的盈利能力。

投资过大

垄断企业为了维持其市场地位和竞争力，可能需要进行巨额的基础设施建设和技术研发投入，这些投资在短期内可能无法带来相应的回报，从而影响企业的盈利能力。

综上所述，垄断石油赔钱的原因是多方面的，包括高昂的成本、不合理的市场定价机制、国企管理问题以及巨额的投资等。要改善这一状况，需要从多个角度进行改革和调整，包括优化成本结构、合理定价、改善国企管理和减少不必要的基础设施投资等。